Este microscopio portátil tipo Ellis es un aparato sencillo y transportable. Fabricado según el modelo descrito en 1755 por John Ellis (1707-1776). Se le denominó microscopio botánico o acuático y fue muy popular. Este aparato es uno de los de mayor tamaño de este tipo que se han fabricado. Mide 21 cm y el estuche en que se aloja 22 x 12 x 9 cm. Este contiene cinco oculares y tres objetivos de diferentes aumentos.

Este modelo fue utilizado en diversas expediciones científicas. Es prácticamente igual al diseñado por Robert Banks y utilizado por Joseph Hooker, el mentor de Darwin. Con este microscopio Robert Brown describió el “movimiento browniano” y las características del núcleo celular y fue utilizado por Charles Darwin en su viaje en el Beagle en 1830.

Otro modelo de microscopio botánico similar fue descrito por G. R. Raspail en 1830 en Francia.